安徽港口集团合肥有限公司（以下简称“合肥公司”）隶属于安徽省港口运营集团有限公司。目前，合肥公司下辖子公司2家（安徽省合肥港国际集装箱码头有限公司和安徽省巢湖市港务有限公司），分公司1家（亚博体彩APP派河分公司）。　 

安徽省合肥港国际集装箱码头有限公司位于合肥市包河区南淝河右岸迎河作业区（以下称“南淝河港区”）,港区占地面积1076亩，使用岸线700米，建成7个2000吨级泊位。近年来，南淝河港区集装箱业务取得突飞猛进的发展，2011年开港首年突破5万标箱，2020年已突破37万标箱。目前，南淝河港区已成为长江支流航道上最大的内河智能化集装箱港口、对外开放二类水运口岸，省、市两级服务业集聚区。  

安徽省巢湖市港务有限公司位于巢湖市东南郊，裕溪河左岸区域（以下称“巢湖港区”），上距巢湖闸4公里，下距长江口57公里，地理位置适中。港区一期占地360亩，岸线820米，建成5个1000吨级泊位（包括散货泊位2个、出口泊位1个，件杂货泊位2个），年设计吞吐能力290万吨。目前，巢湖港区已成为巢湖市发展港口物流经济的“主力军”以及巢湖市工业、矿业和制造业物资的进出物流平台。 

亚博体彩APP派河分公司位于合肥经开区莲花路桥以西、物流园疏港道路以南、派河以北区域（以下称“派河港区”）。港口一期占地497.62亩，使用岸线730米，新建8个2000吨级泊位（其中集装箱泊位4个、件杂泊位3个、商品车滚装泊位1个），年通过能力390万吨。港区航道处于引江济淮工程中心段，区位优势明显。预计今年年底正式投入运营。

未来，合肥公司将在省港航集团和港口运营集团的正确领导下，依托江淮运河承上启下的区域优势，依据腹地产业布局，明确区域港口功能定位，服务区域经济发展，奋力将合肥港打造成为“江淮航运枢纽”和“世界知名内河港口”。